Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpm1Q2TV84 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpm1Q2TV84 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms