Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms