Protein–RNA interactions for Protein: Q149T7

Ppm1j, Protein phosphatase 1J, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1jQ149T7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Ppm1jQ149T7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Ppm1jQ149T7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppm1jQ149T7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Ppm1jQ149T7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Ppm1jQ149T7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Ppm1jQ149T7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ppm1jQ149T7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppm1jQ149T7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms