Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms