Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrioQ0KL02 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms