Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms