Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21bQ0HA38 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21bQ0HA38 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms