Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Chd8Q09XV5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd8Q09XV5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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