Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms