Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top1Q04750 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top1Q04750 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms