Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx1Q04742 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms