Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms