Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms