Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelaQ04207 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelaQ04207 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms