Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms