Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms