Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms