Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms