Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms