Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms