Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelpQ01102 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms