Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms