Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax8Q00288 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms