Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms