Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms