Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms