Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms