Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig3P97386 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig3P97386 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig3P97386 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig3P97386 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms