Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms