Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tubg1P83887 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms