Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms