Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chl1P70232 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chl1P70232 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chl1P70232 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chl1P70232 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chl1P70232 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms