Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tuba1cP68373 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba1cP68373 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms