Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpnP63163 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpnP63163 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms