Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx1P63006 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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