Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps3P62908 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms