Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39P62892 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms