Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms