Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms