Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms