Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abce1P61222 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abce1P61222 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abce1P61222 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms