Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps5P59438 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms