Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms