Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P58686 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P58686 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P58686 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms