Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms