Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms