Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms