Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CdaP56389 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CdaP56389 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CdaP56389 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CdaP56389 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms