Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp5eP56382 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms