Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms